Il existe une stratégie nationale de dépistage COVID-19. Cette stratégie est basée sur l’utilisation des tests antigéniques rapides et la PCR. Cependant, les capacités de l’INSP sont très limitées pour la recherche des variants à travers la biologie moléculaire avancée que cela soit pour la COVID-19 que d’autres maladies à potentiel épidémique (VIH, Hépatites…). Il n’existe pas de protocole standardisé en matière de surveillance moléculaire avancée. Afin de prendre en compte, cette dernière dans la stratégie de dépistage, il est nécessaire d’élaborer et de valider des documents nationaux permettant d’intégrer, organiser et harmoniser la surveillance moléculaire à tous les niveaux de la pyramide sanitaire au Mali.

Par son Programme RC3-Mali, Expertise France souhaite, au travers de cette expertise, accompagner l’INPS dans l’élaboration et la validation de documents nationaux standardisés en matière de surveillance moléculaire avancée (SOP des différentes méthodes et d’autres documents opérationnels tels que document de transport des échantillons, le circuit d’acheminement des échantillons éligibles au dépistage…). En outre, le Programme RC3-Mali appuiera, grâce à la création d’un groupe de travail, la validation des documents nationaux de surveillance moléculaire

OBJECTIF GÉNÉRAL

Contribuer au renforcement de la stratégie nationale de dépistage via une stratégie centrée sur l’intégration de la surveillance moléculaire.

OBJECTIF SPÉCIFIQUE

1. Élaborer et valider les documents nationaux de surveillance moléculaire avancée afin d’améliorer les capacités de l’INSP dans le dépistage, la recherche de variants et la surveillance moléculaire avancée.
2. Appuyer les capacités de l’INSP sur la gestion et l’application des données de surveillance reposant sur le typage moléculaire.

RÉSULTATS

1. La surveillance spécifique aux maladies intégrant un typage génomique est définie, appliquée et mise en œuvre.
2. Les données de typage génomique, qu’elles proviennent des systèmes de surveillance de routine ou relèvent des études des flambées épidémiques multinationales, sont analysées, interprétées et appliquées.
3. La gestion et l’application des données de surveillance reposant sur le typage moléculaire, soutenir l’innovation des systèmes de surveillance au moyen de composantes basées sur le typage moléculaire, et assurer leur intégration dans les données issues de la surveillance de routine sont optimisées.
4. La contribution à la coordination des projets liés à la microbiologie, concernant une maladie spécifique ou plusieurs maladies, est assurée.
5. L’atelier de validation des documents nationaux de surveillance moléculaire avancée est organisé.

APPROCHE MÉTHODOLOGIQUE

L’expert doit proposer une méthodologie claire, cohérente et faisable pour l’appui qu’il va apporter à l’Institut National de Santé publique (INSP) dans l’intégration de la surveillance moléculaire avancée dans leur stratégie de dépistage. Afin de réaliser de manière performante cette mission d’assistance technique, les activités suivantes serviront à la méthodologie proposée :

En collaboration avec l’ensemble de l’équipe projet intervenant dans le projet RC3, l’expert aura en charge de :

• Collaborer et participer à la réunion de cadrage en présence de l’équipe terrain d’Expertise France et de l’INSP ;
• Réaliser une revue documentaire en vue de faire la synthèse des besoins et actions réalisées pour une meilleure gestion de la planification du projet ;
• Organiser des rencontres avec les différentes parties prenantes (responsables des laboratoires centraux, les autorités sanitaires, l’ordre des pharmaciens…)
• Déterminer et définir la surveillance spécifique aux maladies intégrant un type génomique (Visite des autres programmes appuyés par : Fonds Mondial, USAID, AFROSCREEN et soutenant les aspects biologiques du typage génomique.
• Organiser avec l’équipe terrain d’Expertise France sur le terrain un atelier de validation des documents nationaux de surveillance moléculaire avancée.
• Organiser une session de formation théorique et pratique de 5 jours sur les techniques de biologie moléculaire avancée.

La méthodologie utilisera une approche participative. Pour ce faire, l’expert devra privilégier des pratiques professionnelles facilitantes telles qu’un mode de travail collaboratif tout au long de sa mission et sur chacune des activités engagées. Il ou elle fera un diagnostic des besoins et des attentes des partenaires du projet et sera en mesure de faire une analyse des défis et des contraintes dans la mise en pratique de la surveillance moléculaire.

Expertise France mettra à la disposition de l’expert un local pour servir de bureau/salle de réunion avec une connexion internet et la possibilité de réaliser des impressions et photocopies. De plus, un véhicule et un chauffeur assureront les déplacements dans le cadre des activités de la mission. L’expert sera responsable des autres aspects logistiques de sa mission (réservation d’hôtel, billets d’avion, etc.).